民國42年1月16日，因應當地居民之乘車需要，於佳冬至枋寮間增設水底寮站，當時為簡易站。55年1月1日起站名改為建興站，但當地地名仍名為水底寮。
由於旅客稀少之關係，為精簡人事起見，於民國68年1月1日起降為招呼站，並由枋寮站管理。後來，由於車站旅客仍然非常稀少，又本站與東海站之距離過於接近之緣故，再於80年12月1日起廢止
建興站，而廢止不久後，站房、月台以及木造的候車亭均全數被拆除。
- 1953年1月16日：水底寮站設站。設站時為簡易站，並指定由枋寮站管理。
- 1966年1月1日：因行政區域屬枋寮鄉建興村，站名配合地名變更為建興站。
- 1979年1月1日：由簡易站降為招呼站。
- 1991年12月1日：廢站。
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